简介

R语言包在线安装比较简单，离线安装相对麻烦，尤其是解决依赖问题，本文介绍在线和离线安装R语言包的方法。

安装包

Linux系统R语言包在线安装

在Shell命令行终端输入R, 打开R的控制台, 输入:

# 安装 gridExtra
install.packages("gridExtra", dependencies = TRUE) 

这样就可以在可以联网的环境下直接安装了。

Linux系统单个R语言包离线安装

前往 https://cran.r-project.org/web/packages/available_packages_by_name.html 下载需要的语言包，例如gridExtra。

然后把下载 gridExtra.tar.gz 压缩包上传到待安装R语言包的系统上的某个目录，进入该目录，在Shell命令行终端（注意不是R的控制台）输入:

R CMD INSTALL gridExtra.tar.gz

Windows系统批量下载安装包

在windows系统下安装R环境

前往 https://cran.r-project.org/bin/windows/base/ 下载 R 的安装包。

例如：https://cran.r-project.org/bin/windows/base/R-3.6.1-win.exe

我们获得了 R-3.6.1-win.exe 安装包，直接双击运行即可安装成功。

运行成功后，我们在例如 D 盘创建一个文件夹，用于存放下载好的安装包，例如 D:/Rpackages。

然后我们打开R的环境，如下图：

在这个R的控制台输入一些代码，来让R帮助我们自动下载依赖包，例如：

#download  
getPackages <- function(packs){  
  packages <- unlist(  
    tools::package_dependencies(packs, available.packages(),which=c("Depends", "Imports"), recursive=TRUE)  
  )  
  packages <- union(packs, packages)  
  packages
}  
myPackages <- c("raster","gtools", "rhdf5", "dplyr", "DBI", "doBy", "foreign", "ggplot2", "maptools", "ncdf4", "sp", "rgdal", "ROzone2", "baidumap", "magrittr" , "tsModel")  
packages <- getPackages(myPackages)
download.packages(packages, destdir="D:/Rpackages/", type="source")

需要注意的是：

1. myPackages后面添加的是需要安装的包，请依据实际需求修改。
2. destdir="D:/Rpackages/" 为下载目录，可以依据实际需求修改。
3. 执行过程中会弹出选项下载源的提示，可以选择China中的任意一个，例如LanZhou，如下图：

在Linux系统下离线安装R环境

把包和依赖传入离线环境后，在这些安装包所在的目录，运行离线环境中的R环境，打开R的控制台，如下图：

在这个R的控制台输入一些代码，来让R帮助我们自动安装依赖包，例如：

library(tools)  
path <- "./"  
write_PACKAGES(path,type="source")  
myPackages <- c("raster","gtools", "rhdf5", "dplyr", "DBI", "doBy", "foreign", "ggplot2", "maptools", "ncdf4", "sp", "rgdal", "ROzone2", "baidumap", "magrittr" , "tsModel") 
install.packages(myPackages, contriburl=paste("file:",path,sep=''),type="source")  

需要注意的是：

1. path <- "./" 表示当前目录。如果提示找不到安装包，请使用cd 命令切换到上传安装包的目录。

坑

stringi

报错： checking whether we can fetch icudt... downloading the ICU data library (icudt)

解决方法： 手动下载一个master版本的，包含这个坑爹的包.... https://raw.githubusercontent.com/gagolews/stringi/master/INSTALL

qvalue

Package ‘qvalue’ was removed from the CRAN repository. Formerly available versions can be obtained from the archive. This package is now available from Bioconductor only, see http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/qvalue.html (opens new window)

备注

官网地址：传送门 (opens new window)

参考文章：R语言离线下载包和依赖 (opens new window)